牛津仪器 Andor Technology 发布 Imaris 8.2 — 用于探索细胞谱系的新技术
2016年2月18日

Imaris 的三个界面(Arena, Surpass, 及Vantage)顺序排列, 引导您自然而然地完成不同阶段的工作。针对三维长时间序列图像,Imaris 8.2 着力打破其主要的瓶颈 — 展示及分析的效率问题。它进一步加快了从原始数据格式到.ims 格式的转换速度,从而大大缩短了文件打开所需的时间。在原有ImarisCell 及ImarisTrack 这两个高效且强大的模块基础上,Imaris 8.2 还引入了新模块ImarisLineage。它可以检测细胞分裂,并自动描绘细胞谱系图,用于细胞命运及细胞分化方面的研究。

  • 管理,标记,及查找数据
  • 展示及分析三维/四维大数据
  • 追踪细胞运动及分裂
  • 描绘可交互操作的细胞谱系图
  • 鉴别展示总体趋势及异常值
数据管理
新界面Arena 是Imaris存储中枢,它使用多层目录,分管您的图像,自动记录并展示您的试验方法。您还可以将整理好的目录及数据储存在本地或网络服务器上。在新界面中,您可以选择为某张或某组图像添加标签,并在所有数据中搜索带有标记的图像或分组。
图像展示
Imaris 可以交互展示上百GB 或上千时间点的二维三维数据。在Surpass 界面中,有一系列的高性能高质量的展示工具。Volume 及Surface 工具利用显卡加速结构渲染,配合正交面及斜截面投影模式,即使面对最复杂的三维生物数据,也可轻松呈现其任意剖面的信息。
分析及批处理
Imaris 具有强大而全系列分析工具,每种都采取简便的“向导”方式来使用。它们主要应用于组织,细胞及细胞器检测,物体动态追踪,丝状体描绘(如神经元的树突,树突棘,细胞骨架,血管)等方面。在Surpass 界面下,通过交互式操作确定了图像的分析方法之后,您可以在Arena 界面下将其应用于大批图像(如一整个试验组)的自动处理。批处理是一个效率极高的工具,它充分利用全部的CPU 资源。
数据对比
每一项科学研究的核心问题:“试验组”与“对照组”之间是否存在显著差异?在Arena 界面下,选中待评估的平行组,将它们导入Vantage 界面下作图,即可验证相关的假设。在Vantage 界面下,您可以同时比较五种参数,包括定义x/y/z 坐标上的三种参数,以及设定颜色和显示比例两种物体特性参数。这一灵活的设定允许您快速地尝试各种参数,从而确定数据的总体趋势和异常值。点击一下,就可将相关数据导出,并在您常用的统计软件中进行统计学测试。
结果呈现
当复杂的分析工作完成后,Imaris 的一整套制作工具,将为您呈现专业级的视频输出效果。您可以添加文字说明,标注三维空间内的关键结构或特性;将Vantage/Surpass 界面下的结果以最佳的角度或照明效果保存成高分辨图像用于后续发表;充分发挥想象,将展示过程录制成视频。您的发布及演讲内容将会被推倒一个新高度,它将更加丰富多彩,您的发现会更引人注目。
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